1、連續掃描細胞、組織、活細胞，獲得單個細胞或一組細胞不同層次的詳細圖像；

　　2、激光熒光共聚焦顯微鏡能對熒光標記或自發熒光的微米或納米球進行成像觀察，能觀察到熒光標記藥物在載體中的分布；

　　3、可用于藥物載體、藥物對細胞的作用及其動力學研究，可使用熒光標記測量細胞內鈉、鈣、鎂、pH等血漿濃度比和動態變化；

　　4、可用于研究熒光標記或自發熒光微米或納米藥物載體的吞噬行為及其在組織中的分布。

　　激光熒光共聚焦顯微鏡可用于觀察各種染色、非染色和熒光標記的組織和細胞，觀察和研究組織切片、活細胞的生長發育特性，研究和確定物質的運輸和細胞中的能量轉換。能夠開展活細胞中離子和pH變化的研究，神經遞質研究，涉及熒光斷層掃描的微分干擾，多重熒光斷層掃描和重疊，熒光光譜，熒光指標的定量分析，時間延遲掃描和熒光樣品的動態三維組成組織和細胞的動態結構，熒光共振能量轉移分析，熒光原位雜交研究，細胞骨架研究，基因定位研究，原位實時PCR產物分析，熒光漂白恢復研究，細胞間通訊研究，蛋白質時間研究，膜電位和膜流動性研究，完整圖像分析和三維重建分析。